Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ91

Ndufa3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa3Q9CQ91 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufa3Q9CQ91 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufa3Q9CQ91 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms