Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med21Q9CQ39 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med21Q9CQ39 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med21Q9CQ39 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med21Q9CQ39 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med21Q9CQ39 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med21Q9CQ39 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med21Q9CQ39 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med21Q9CQ39 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med21Q9CQ39 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms