Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim26Q99PN3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim26Q99PN3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim26Q99PN3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim26Q99PN3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim26Q99PN3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms