Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scd3Q99PL7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scd3Q99PL7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scd3Q99PL7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scd3Q99PL7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms