Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc24a3Q99PD7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc24a3Q99PD7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc24a3Q99PD7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc24a3Q99PD7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc24a3Q99PD7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Slc24a3Q99PD7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms