Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Rad54l2Q99NG0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rad54l2Q99NG0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rad54l2Q99NG0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rad54l2Q99NG0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rad54l2Q99NG0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rad54l2Q99NG0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rad54l2Q99NG0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Rad54l2Q99NG0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rad54l2Q99NG0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Rad54l2Q99NG0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rad54l2Q99NG0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rad54l2Q99NG0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rad54l2Q99NG0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rad54l2Q99NG0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rad54l2Q99NG0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rad54l2Q99NG0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rad54l2Q99NG0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rad54l2Q99NG0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rad54l2Q99NG0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rad54l2Q99NG0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Rad54l2Q99NG0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Rad54l2Q99NG0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rad54l2Q99NG0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Rad54l2Q99NG0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms