Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acss1Q99NB1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Acss1Q99NB1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acss1Q99NB1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms