Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Brms1Q99N20 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brms1Q99N20 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brms1Q99N20 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brms1Q99N20 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brms1Q99N20 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms