Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a6cQ99N08 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a6cQ99N08 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms