Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML2

Tnk1, Non-receptor tyrosine-protein kinase TNK1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk1Q99ML2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnk1Q99ML2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk1Q99ML2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnk1Q99ML2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnk1Q99ML2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk1Q99ML2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk1Q99ML2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnk1Q99ML2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk1Q99ML2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnk1Q99ML2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnk1Q99ML2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms