Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdpd3Q99LY2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdpd3Q99LY2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdpd3Q99LY2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms