Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdk5rap3Q99LM2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk5rap3Q99LM2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap3Q99LM2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap3Q99LM2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.6 ms