Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abtb1Q99LJ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abtb1Q99LJ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abtb1Q99LJ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abtb1Q99LJ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms