Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cstf3Q99LI7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cstf3Q99LI7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cstf3Q99LI7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms