Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmp1Q99KU0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmp1Q99KU0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms