Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clint1Q99KN9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clint1Q99KN9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms