Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrabdQ99JY4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrabdQ99JY4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TrabdQ99JY4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrabdQ99JY4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms