Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Mcoln1Q99J21 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcoln1Q99J21 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcoln1Q99J21 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcoln1Q99J21 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mcoln1Q99J21 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcoln1Q99J21 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms