Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atad3Q925I1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad3Q925I1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atad3Q925I1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atad3Q925I1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms