Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf144aQ925F3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf144aQ925F3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf144aQ925F3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf144aQ925F3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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