Protein–RNA interactions for Protein: Q923S9

Rab30, Ras-related protein Rab-30, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab30Q923S9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab30Q923S9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab30Q923S9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab30Q923S9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab30Q923S9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab30Q923S9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms