Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Riok1Q922Q2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Riok1Q922Q2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms