Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SncbQ91ZZ3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncbQ91ZZ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncbQ91ZZ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms