Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZA3

Pcca, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccaQ91ZA3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PccaQ91ZA3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PccaQ91ZA3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PccaQ91ZA3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PccaQ91ZA3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PccaQ91ZA3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms