Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Basp1Q91XV3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Basp1Q91XV3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms