Protein–RNA interactions for Protein: Q91WT8

Rbm47, RNA-binding protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm47Q91WT8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm47Q91WT8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm47Q91WT8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm47Q91WT8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm47Q91WT8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm47Q91WT8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm47Q91WT8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm47Q91WT8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm47Q91WT8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm47Q91WT8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm47Q91WT8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm47Q91WT8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm47Q91WT8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms