Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Klc3Q91W40 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Klc3Q91W40 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Klc3Q91W40 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Klc3Q91W40 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Klc3Q91W40 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Klc3Q91W40 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Klc3Q91W40 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Klc3Q91W40 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klc3Q91W40 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Klc3Q91W40 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms