Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam3cQ91VU0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam3cQ91VU0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam3cQ91VU0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms