Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE5

Pcdhb10, Protocadherin beta 10, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb10Q91VE5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb10Q91VE5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb10Q91VE5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb10Q91VE5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb10Q91VE5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb10Q91VE5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb10Q91VE5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb10Q91VE5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb10Q91VE5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb10Q91VE5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb10Q91VE5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb10Q91VE5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb10Q91VE5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb10Q91VE5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms