Protein–RNA interactions for Protein: Q91V81

Rbm42, RNA-binding protein 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm42Q91V81 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm42Q91V81 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm42Q91V81 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm42Q91V81 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm42Q91V81 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbm42Q91V81 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm42Q91V81 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms