Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RestQ8VIG1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RestQ8VIG1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RestQ8VIG1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RestQ8VIG1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RestQ8VIG1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RestQ8VIG1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RestQ8VIG1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RestQ8VIG1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RestQ8VIG1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RestQ8VIG1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RestQ8VIG1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RestQ8VIG1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RestQ8VIG1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RestQ8VIG1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RestQ8VIG1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RestQ8VIG1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RestQ8VIG1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RestQ8VIG1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms