Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI47

Abcc2, Canalicular multispecific organic anion transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc2Q8VI47 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Abcc2Q8VI47 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Abcc2Q8VI47 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Abcc2Q8VI47 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Abcc2Q8VI47 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Abcc2Q8VI47 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Abcc2Q8VI47 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Abcc2Q8VI47 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Abcc2Q8VI47 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Abcc2Q8VI47 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Abcc2Q8VI47 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Abcc2Q8VI47 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc2Q8VI47 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc2Q8VI47 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc2Q8VI47 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abcc2Q8VI47 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc2Q8VI47 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc2Q8VI47 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc2Q8VI47 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc2Q8VI47 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abcc2Q8VI47 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abcc2Q8VI47 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abcc2Q8VI47 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc2Q8VI47 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc2Q8VI47 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc2Q8VI47 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc2Q8VI47 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Abcc2Q8VI47 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc2Q8VI47 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc2Q8VI47 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc2Q8VI47 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc2Q8VI47 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc2Q8VI47 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc2Q8VI47 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc2Q8VI47 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc2Q8VI47 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc2Q8VI47 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc2Q8VI47 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc2Q8VI47 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc2Q8VI47 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc2Q8VI47 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc2Q8VI47 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc2Q8VI47 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc2Q8VI47 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms