Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms