Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Sgip1Q8VD37 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sgip1Q8VD37 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sgip1Q8VD37 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sgip1Q8VD37 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sgip1Q8VD37 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sgip1Q8VD37 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sgip1Q8VD37 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sgip1Q8VD37 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sgip1Q8VD37 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sgip1Q8VD37 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sgip1Q8VD37 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sgip1Q8VD37 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sgip1Q8VD37 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms