Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCX6

Kptn, KICSTOR complex protein kaptin, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KptnQ8VCX6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KptnQ8VCX6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KptnQ8VCX6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KptnQ8VCX6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KptnQ8VCX6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KptnQ8VCX6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KptnQ8VCX6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KptnQ8VCX6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KptnQ8VCX6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
KptnQ8VCX6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KptnQ8VCX6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KptnQ8VCX6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KptnQ8VCX6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms