Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn4Q8VCH8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn4Q8VCH8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn4Q8VCH8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn4Q8VCH8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms