Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clptm1Q8VBZ3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clptm1Q8VBZ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clptm1Q8VBZ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms