Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms