Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc16Q8R349 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc16Q8R349 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc16Q8R349 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms