Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2f4Q8R0K9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2f4Q8R0K9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
E2f4Q8R0K9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
E2f4Q8R0K9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2f4Q8R0K9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms