Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps37bQ8R0J7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps37bQ8R0J7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps37bQ8R0J7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms