Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms