Protein–RNA interactions for Protein: Q8K572

Hus1b, Checkpoint protein HUS1B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hus1bQ8K572 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hus1bQ8K572 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hus1bQ8K572 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hus1bQ8K572 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hus1bQ8K572 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms