Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fndc5Q8K4Z2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc5Q8K4Z2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc5Q8K4Z2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms