Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X8

Gtf2h5, General transcription factor IIH subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h5Q8K2X8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2h5Q8K2X8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2h5Q8K2X8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2h5Q8K2X8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2h5Q8K2X8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms