Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FntbQ8K2I1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FntbQ8K2I1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FntbQ8K2I1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FntbQ8K2I1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms