Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Colgalt1Q8K297 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Colgalt1Q8K297 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Colgalt1Q8K297 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Colgalt1Q8K297 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Colgalt1Q8K297 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Colgalt1Q8K297 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Colgalt1Q8K297 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Colgalt1Q8K297 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Colgalt1Q8K297 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Colgalt1Q8K297 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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