Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c1Q8K284 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c1Q8K284 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c1Q8K284 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c1Q8K284 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c1Q8K284 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms