Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcf3Q8K268 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf3Q8K268 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf3Q8K268 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf3Q8K268 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf3Q8K268 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf3Q8K268 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf3Q8K268 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf3Q8K268 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf3Q8K268 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf3Q8K268 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf3Q8K268 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf3Q8K268 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf3Q8K268 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms