Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Neil3Q8K203 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Neil3Q8K203 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms